با تشکیل شورای دفاع که گفته شده بر اساس قانون اساسی از شوراهای فرعی شورای عالی امنیت ملی است، این سؤال مطرح است که کاربرد آن چه تفاوتی با نهاد بالادستی خود دارد.
با توجه به انتصاب علی شمخانی و علی اکبر احمدیان، دو شخصیت نظامی ارشد برای نمایندگی رهبر جمهوری اسلامی در این شورا، به نظر میرسد که این نهاد جدید تفاوت عمدهای با شوراهای فرعی پیشین دارد.
شورای دفاع؛ نهاد فرعی یا ساختاری موازی با شورای عالی امنیت ملی؟